运输公司归哪个部门管？

运输公司通常归交通运输部门或者地方交通运输管理部门管辖。交通运输部门是负责管理和监督道路、水路、航空、铁路等各类交通运输的行政管理机构。其下设有各级交通运输管理部门，负责监管和管理本地区内的各类交通运输企业和行业。

根据《中华人民共和国公路法》、《中华人民共和国铁路法》、《中华人民共和国民用航空法》等法律法规，道路运输企业归省级交通运输管理部门管辖，航空运输企业归民航局管辖，铁路运输企业归铁路局、铁路运输管理部门管辖，水路运输企业归水运管理部门管辖。

法律依据

《中华人民共和国道路交通安全法》第五条

国务院公安部门负责全国道路交通安全管理工作。县级以上地方各级人民政府公安机关交通管理部门负责本行政区域内的道路交通安全管理工作。县级以上各级人民政府交通、建设管理部门依据各自职责，负责有关的道路交通工作。